Избран е за професор и ст.н.с. І ст. (1966)

В Института за ядрени изследвания и ядрена енергетика ръководи Сектор по неутронна и реакторна физика и ядрена енергетика (1966–1980) и Секция по неутронно-физични и неутронно-оптични изследвания (1980–1988)

Никифор Кашукеев е заместник-директор на Физическия институт с Атомна научно експериментална база (1968–1970)

Голяма част от дейността му преминава в Лабораторията по неутронна физика на Обединения институт за ядрени изследвания в Дубна (Русия)

Преподавателска дейност

В Катедрата по атомна физика на Софийски университет чете лекции по неутронна физика (1949–1963)

Публикации

Н. Кашукеев има 100 научни труда, 8 обзора, издаден един университетски учебник и 4 авторски свидетелства (2 признати в България и 2 в Русия)

1. С. Иванов, Н. Кашукеев, Л. п. Христов, М. Андреев, Ръководство за лабораторни упражнения по опитна физика, Наука и изкуство, София (1951) [Е. Наджакова]

2. М. Борисов, Н. Кашукеев, Луминесцентна дефектоскопия, Природа 4(2) 63–68 (1955)

3. Н. Кашукеев, М. Борисов, Атомната енергия и нейното използуване, Природа, 4(1) 45–51; (2) 11–19; (3) 35–50 (1955)

4. Н. Кашукеев, П. Петков, Атомно оръжие и противоатомна защита, Военно издателство, София (1958)

5. Г. Наджаков, Р. Андрейчин, Н. Кашукеев, Физически институт с атомна научно-експериментална база, Физико-математическо списание, 12(4) 255-264 (1969)

6. Н. Кашукеев, Твърди диелектрични детектори и техните приложения, Наука и изкуство, София (1973)

7. Н. Кашукеев, Ултрастудени неутрони, B: Проблеми на съвременната физика, Наука и изкуство, София (1976)

8. Н. Кашукеев, Фотоелектрети и фотоелектретно състояние (за Г. Наджаков), Физика (2) 25-28 (1987)

9. Н. Кашукеев, Делото на Академик Георги Стефанов Наджаков (По случай 90 години от рождението му), Природа (3) 88–91 (1987)